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pipeline
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Image embedding与某种疾病的entity knowledge embedding(先通过wiki&UMLS知识库构建,然后通过BoiClinical-Bert编码)共同输入模型,预测这种疾病的有/无,位置,特征图
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$$ \hat{s},\hat{p},\hat{m}=\Phi_{fusion}(v,Q) $$
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训练时,选取Train Set中的Top Q疾病的知识编码进行训练;
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推断时,基于该疾病的医学知识编码进行推断
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训练
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Pseudo label
- 疾病是否存在
- 疾病处于何处:使用BioClinical-Bert进行编码
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$$ p=\Phi_{text}(\text{“it is located at {position}”}) $$
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Fine-grained supervision
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疾病有无:BCE Loss
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疾病位置:将该疾病的位置编码和其他M种位置编码进行对比学习(因为位置编码的类别数未知)
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$$ L_{loc}=-\frac{1}{Q}\sum_k^Q\frac{e<\hat{p}_k,p_k>}{e<\hat{p}_k,p_k>+\sum_u^M{e<\hat{p}_k,p_k>}} $$
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